当前养猪消毒的误区一是：未发生疫病可以不进行消毒或少消毒。消毒的主要目的是杀灭传染源的病原体，疫病发生要有三个基本环节：传染源、传播途径、易感动物。在养猪生产中，有时没有疫病发生，但外界环境存在传染源，传染源会释放病原体，病原体就会通过空气、饲料、饮水和其它生物等途径，入侵易感猪，引起疫病发生.如果没有及时消毒、净化环境，环境中的病原体就会越积越多，超出猪体承受浓度时，就会引起疫病大发生。因此，未发生疫病地区的养猪户更应进行严格到位的消毒，防患于未然。
当前养猪消毒误区二是：消毒前，环境没有做彻底大扫除。由于养猪场存在大量的有机物，如粪便、饲料残渣、猪分泌物、体表脱落物，以及鼠粪、污水或其它污物，这些有机物中藏匿有大量病原微生物；这会消耗或中和消毒剂的有效成分，严重降低了对病原微生物的作用浓度，所以说，彻底清除是有效消毒的前提（彻底清扫粪尿是最便宜、最有效的消毒）。
当前养猪消毒误区三是：已经消过毒猪就不会再发生传染病。尽管进行了消毒，但并不一定就能收到彻底的消毒效果，这与选用的消毒剂品种、消毒剂质量及消毒方法有关。就是已经彻底规范消毒后，短时间内很安全，但许多病原体可以通过空气、飞禽，老鼠等媒体传播，猪自身不断污染环境，也会使环境中的各种致病微生物大量繁殖，所以必须定时、到位、彻底、规范消毒，同时结合有计划地免疫接种，才能做到猪不得病或少得病。
当前养猪消毒误区四是：消毒剂气味越浓，消毒效果越好。消毒效果的好坏，主要和它的杀菌能力、杀菌谱及渗透能力有关。目前国际上一些先进的、好的消毒剂是没有什么气味的，如聚维酮碘等；相反有些气味浓、刺激性大的消毒剂，存在着消毒盲区，且气味浓、刺激性大的消毒剂对猪呼吸道、体表等有一定的伤害，反而易引起呼吸道病。
当前养猪消毒误区五是：需要经常更换消毒剂。消毒剂的作用机制:细胞壁的破坏、菌体蛋白质变性、抑制酵素活性；抗生素的作用机制:细胞壁合成阻碍、蛋白质合成阻碍、核酸合成阻碍；我个人认为不需要经常更换消毒药！