发酵床的建设要因地制宜。在东北，要考虑夏季的通风降温和冬季的防寒和排湿。因此，东北发酵床猪舍应该是封闭式的。猪舍的举架以发酵床的表面算起，最低不得低于2.5 米，最好达到3米，这样的空间有利于空气的快速流动。猪舍的宽度在10 米左右为宜。猪舍的长度可以20～60 米。南窗要尽量的大，这样才能使猪舍阳光普照，生物发酵床猪舍非常强调猪舍采光的重要性，因为阳光可以使猪感到温暖，阳光可以使生物发酵菌繁殖得更好，阳光能够使猪舍的水分迅速的蒸发，可见，在生物发酵床猪舍设计时，猪舍的采光和通风是最重要的，这是不同于常规水泥地面猪舍的最重要的特点。另外，发酵池的四壁，尤其是靠外墙处应当考虑做苯板防寒层，南方不需要这样做，但是在东北冬季必需要防寒层。
